RNA提取純化操作過程,提取的時候有什么注意事項呢?
RNA提取純化操作過程:
1. 加入AMPure XP 磁珠試劑
2. 磁珠與核酸結合
3. 結合有核酸的磁珠與雜質分離
4. 乙醇洗滌
5. 加入洗脫液
6. 轉移洗脫產物
RNA提取注意事項:
1.RNA在細胞內極易降解,樣本選擇時***定要選取新鮮的樣本組織或者取樣后迅速低溫處理(液氮速凍);樣本出現多次反復凍融后,RNA得率會嚴重下降,也會導致RNA降解;RNA提取環境要保持無RNA酶污染;
2.RNA容易受到環境污染導致RNA嚴重降解,建議實驗過程中注意更換實驗手套,使用所有耗材應該均無RNA酶的***次性耗材;
3.試劑盒中BufferEB中含有少量EDTA,可能影響下游實驗,使用時適當稀釋,如果用其他洗脫液洗脫,要確保PH>7.5,PH過低影響洗脫效率;
4.離心柱漂洗完成后,盡可能烘干柱膜上殘留乙醇,殘留乙醇會影響洗脫效率和下游實驗效果;柱膜也不建議過度干燥,沒有乙醇味道殘留***好,如果過度干燥可能影響RNA溶解;如果A260/230值過低,說明樣本提取過程中漂洗不徹底,有鹽離子殘留,建議增加漂洗次數;
5.對于RNA提取,A260/280<1.9說明有可能存在DNA污染或者蛋白污染,如果洗脫樣本時沒有使用BufferEB,而使用ddH20(確保無RNA酶),比值或偏低,因為Ph值會影響吸光值,并不表示樣本純度低;
6.如果提取的樣本RNA發生嚴重降解,可能是由于裂解液沒能完全滅活樣本中RNA酶,建議增加裂解液使用量(具體參見說明書)或者降低樣本初始量;
7.RNA完整性可以通過超微量核酸檢測儀檢測或者瓊脂糖凝膠電泳(電泳條件:膠濃度1%;1XTAE電泳緩沖液)來判斷;***般樣本RNA電泳條帶為兩條帶,對于植物樣本,有可能存在葉綠體RNA干擾,條帶數量大于4條,并不表示RNA提取發生降解;
8.電泳環境受到RNA酶污染,也會造成RNA降解,電泳檢測不準確,確保電泳過程中電泳緩沖液,上樣緩沖液無RNA酶污染;
9.RNA提取***般是傳統TRIzol方法和改進的柱式方法;對于TRIzol法進本可以提取大部分樣本RNA,但是對于多糖多酚植物樣本,建議使用者盡量選擇具有針對性的試劑盒(參見目錄),傳統TRIzol法無法有效去除多糖多酚這些次生代謝物;
10.對于植物樣本,樣本處理量無法統***確定,對于***般樣本(煙草,擬南芥等),提取量不超過100mg鮮重組織或者20mg干重組織,對于復雜樣本,建議初始樣本量不超過50mg鮮重或者10mg干重組織;如果需要較高的RNA量,可以采取多管濃縮的方法提取RNA;
11.對于植物樣本,如果離心時堵塞離心柱,建議減少初始樣本量;
12.對于血液樣本,如果樣本中含有血塊,說明樣本收集時未加入血液抗凝劑;建議重新收集樣本并加入EDTA,肝素,檸檬酸等抗凝劑;
13.RNA濃度及純度判斷:[RNA]μg/ml=A260 x稀釋倍數x40.0 (40.0:RNA的平均吸收系數)